Mikrobiom analízis alapú szolgáltatás fejlesztése neuropszichiátriai betegségek vizsgálatára

Az InnovITech Kft. és az UD-GENOMED Kft. közös projektje során a cél egy olyan informatikai rendszer megvalósítása, amely segítségével elvégezhető a bélflóra összetétele és különböző pszichés megbetegedések közötti összefüggések automatizált analízise. Ennek keretében a tervezett rendszer képes lesz a vizsgált páciensekhez kapcsolódó klinikai adatok rögzítésére, a teljes körű mikrobiom-elemzések végigkövetésére, valamint a klinikai és újgenerációs szekvenálási adatok közötti összefüggések feltárására.

A tervezett rendszer fontos funkciójaként jelöljük meg a mikrobiom és klinikai adatok közötti összefüggések elemzésére irányuló BigData eljárásokra épülő szakértői rendszer modul kialakítását. A feltárt ok-okozati összefüggések elemzésével közelebb kerülhetünk a bélflóra és a pszichés megbetegedések közötti komplex kölcsönhatások megértéséhez, valamint kialakíthatunk predikciós eljárásokat is a gyógyszeres kezelés hatékonyságának növelése érdekében. Az alkalmazásnak ezen felül képesnek kell lennie az összehasonlítások és szűrések eredményeként azonosított baktérium-csoportok taxon-annotációjának elvégzésére (Törzs, Osztály, Rend, stb.) is a meglévő metagenom adatbázisok alapján.

A tervezett rendszer által nyújtott szolgáltatás révén a betegek székletmintájából nyomon követhető lenne a depressziós és figyelemhiányos hiperaktivitás-zavarral diagnosztizált betegek állapota, betegségük kronológiája. A szolgáltatás megrendelői elsősorban olyan klinikusok vagy betegek lehetnek, akiknek az összefüggések megállapítása segíthet a megfelelő kezeléstípus kiválasztásában, illetve megerősítést nyerhetnek a terápia hatékonyságát illetően. Az informatikai rendszernek támogatnia kell a teljes vizsgálati folyamatot, beleértve a megrendelő által küldött székletmintákból történő bakteriális DNS-kivonás kísérletes folyamatának nyomon követését, az izolátumok minőségellenőrzését, a szekvenálási könyvtárak készítését, valamint a minták teljes körű automatizált bioinformatikai analízisét.

A tervezett rendszernek fontos funkciója lesz, hogy a beérkezett kísérleti nyersanyagokkal kapcsolatos feldolgozási munkafolyamatról és az előálló eredményekről egy authorizált webes felületen tájékoztatja a megrendelőt, illetve lehetőséget nyújt a mintákon elvégzett statisztikai analízisek finomhangolására is a statisztikai tesztek átállításával vagy a használt küszöbértékek módosításával. A kifejlesztendő szolgáltatást súlyos depresszív zavarral, illetve az ún. figyelemhiányos hiperaktivitás-zavarral diagnosztizált, terápiás kezelésen is átesett páciensek mikrobiom adatainak elemzésével tervezzük tesztelni.